法律赋予了用人单位自主用工的权利，用人单位对劳动者有管理权，劳动者应当遵守用人单位依法指定的劳动规章制度。同时，为了避免用人单位滥用管理权，侵害劳动者合法权益，公司如果要制定新的规章制度，应当经过法定民主程序充分协商，并在制定后向劳动者公示。新的劳动规章制度制定后，应当严格依照该劳动规章制度的规定对劳动者进行管理。

如果员工确实存在违反公司纪律的行为，需要经过调查核实和民主讨论的形式进行处理。包括部门主管会同工会主席与员工进行谈话，听取员工申辩，所有程序都必须公开透明且记录在案。确保对员工的处罚合理合规。只有经过所有的查证程序、谈话流程，才可以解除劳动合同。这样，公司解除劳动合同是正当合法的。否则将承担违法解除劳动合同的法律后果。