摩托车酒驾是否会留下案底，取决于具体情况的评估。

首先，对于一般的酒驾行为，即车辆驾驶人员血液中的酒精含量在20mg/100ml至80mg/100ml之间，这通常被视为饮酒驾驶，一般情况下不会留下案底。然而，如果酒驾导致事故并涉嫌交通肇事罪，那么将需要承担刑事责任，此时就会有案底记录。

其次，对于酒驾被行政拘留的情况，这是行政处罚的一种形式，并非刑事处罚，因此不会留下刑事案底。但是，被行政拘留的记录会在公安机关的治安管理部门有记录。

再者，如果酒驾达到醉酒驾驶的标准，即血液中的酒精含量大于或等于80mg/100ml，这会被视为危险驾驶罪或交通肇事罪，公安机关可以对此进行刑事拘留。在刑事拘留后，如果经法院判决确实构成犯罪，那么就会留下案底；如果经法院判决不构成犯罪的，则不会留下案底。

案底，通常指的是某人犯罪行为的记录，也就是犯罪人员犯罪记录制度。在我国，这些犯罪档案一般由公安部门保存。

关于醉酒驾驶机动车的具体处罚措施包括：吊销驾驶证、禁止重新取得驾驶证、罚款以及可能的拘役等。如果醉酒驾驶还导致重大交通事故并造成人员重伤或死亡，还可能被追究交通肇事罪的刑事责任，同时也会被吊销驾驶证并终身禁止重新取得。

总的来说，摩托车酒驾是否会留下案底，需要根据酒驾的严重程度、是否导致事故以及法院的判决结果来确定。

【法律依据】

《公安机关办理犯罪记录查询工作规定》第二条

本规定所称的犯罪记录，是指我国国家专门机关对犯罪人员的客观记载。除人民法院生效裁判文书确认有罪外，其他情况均应当视为无罪。

有关人员涉嫌犯罪，但人民法院尚未作出生效判决、裁定，或者人民检察院作出不起诉决定，或者办案单位撤销案件、撤回起诉、对其终止侦查的，属于无犯罪记录人员。

第三条

公安部建立犯罪人员信息查询平台。查询结果只反映查询时平台录入和存在的信息。