在起诉离婚的过程中，如果原告需要证明双方因感情不和分居，可以采取以下方式来证明：

1. 提供双方签订的合法有效的分居协议。分居协议是双方自愿达成的书面协议，明确规定了双方分居的时间、地点和原因等。这种协议可以作为证据，证明双方确实因为感情不和而分居超过两年。

2. 提供一方在外的租房合同。如果一方在外租房居住，可以提供租房合同作为证据。租房合同上会有租赁的起止时间，可以证明该方已经在外居住超过两年。

3. 邻居、朋友可以出具证人证言。如果有人可以证明双方分居的事实，可以请他们出庭作证或者提供书面证词。这些证人可以是邻居、朋友或者其他知情人。他们的证言可以证明双方的感情状况以及分居的事实。

4. 提供微信、短信、邮件等涉及分居的内容。如果双方在分居期间有过微信、短信、邮件等通信记录，可以提供这些记录作为证据。这些记录中可能包含双方讨论分居事宜的内容，可以证明双方确实因为感情不和而分居超过两年。