无法办理确权登记的房屋有：

1、乱占耕地建房；

2、违反生态保护红线管控要求建房；

3、城镇居民非法购买宅基地；

4、小产权房，通常意义上的小产权房是指农村集体土地上建设，未缴土地出让金等费用，产权证不是由国家房管部门颁发，而是由乡镇政府或村委会颁发的房屋，亦称“乡产权房”。

【法律依据】

《土地管理法》第三十七条，非农业建设必须节约使用土地，可以利用荒地的，不得占用耕地；可以利用劣地的，不得占用好地。  

禁止占用耕地建窑、建坟或者擅自在耕地上建房、挖砂、采石、采矿、取土等。 禁止占用永久基本农田发展林果业和挖塘养鱼。