有限责任公司章程是由股东大会制定的。根据我国《公司法》的规定，公司章程的修改应依照以下程序进行：

1．由公司董事会作出修改公司章程的决议，并提出章程修改草案。

2．股东会对章程修改条款进行表决。有限责任公司修改公司章程，须经代表三分之二以上表决权的股东通过；股份有限公司修改章程，须经出席股东大会的股东所持表决权的三分之二以上通过。

3．公司章程的修改涉及需要审批的事项时，报政府主管机关批准。如股份有限公司为注册资本而发行新股时，必须向国务院授权的部门或者省级人民政府申请批准；

属于向社会公开募集的，须经国务院证券管理部门批准。

4．公司章程的修改涉及需要登记事项的，报公司登记机关核准，办理变更登记；未涉及登记事项，送公司登记机关备案。

5．公司章程的修改涉及需要公告事项的，应依法进行公告。如公司发行新股募足股款后，必须依法定或公司章程规定的方式进行公告。

6．修改章程需向公司登记机关提交股东会决议及章程修正案，若涉及登记事项，须有公司法人签章方可完成变更。