离婚后男方不配合子女户口迁移的可以起诉至法院要求其配合。起诉书可以说明相关情况，户籍因故迁移需要户主或本人至当地户口登记机关申请变更。法院会要求男方配合登记，至迁入地和迁出地分别办理相关手续即可。

【法律依据】

《中华人民共和国户口登记条例》第十九条 公民因结婚、离婚、收养、认领、分户、并户、失踪、寻回或者其他事由引起户口变动的时候，由户主或者本人向户口登记机关申报变更登记。