申请软件著作权的流程如下：

1、向版权保护中心提出申请；

2、提交申请书等需要的材料；

3、版权保护中心受理申请并发出受理通知书；

4、审核通过后予以登记并予以公告。

【法律依据】

《中华人民共和国著作权法》第十二条，在作品上署名的自然人、法人或者非法人组织为作者，且该作品上存在相应权利，但有相反证明的除外。

作者等著作权人可以向国家著作权主管部门认定的登记机构办理作品登记。

与著作权有关的权利参照适用前两款规定。