软件著作权与专利能同时申请，二者互不影响，保护的内容也不同。中国公民、法人或者其他组织对其所开发的软件，不论是否发表，依照本条例享有著作权。《专利法》规定，对发明人或者设计人的非职务发明创造专利申请，任何单位或者个人不得压制。

【法律依据】

《专利法》第三条，国务院专利行政部门负责管理全国的专利工作；统一受理和审查专利申请，依法授予专利权。

省、自治区、直辖市人民政府管理专利工作的部门负责本行政区域内的专利管理工作。