工程专业分包合同需要备案，施工总承包单位和专业分包单位备案原因如下：

1、根据法定要求，总承包单位都对施工安全、质量等负有主要责任的，所以为了对中下层服务单位有一定的约束，就形成了协议合同以及备案这一种书面文件。

2、总包对应的便是分包，意义有着买卖方、委托与被委托、甲方和乙方等类似的合法关系，只是通过书面形式、并备案到当地建设部门，才能使得项目施工正常开展，使工程得以进行。

3、公检法是根据合同或协议、有依有据、依法办事的合同备案是指加工贸易企业持合法的加工贸易合同到主管海关备案、申请保税并领取加工贸易《登记手册》或其他准予合同备案凭证的行为。

【法律依据】

《房屋建筑和市政基础设施工程施工招标投标管理办法》第四十七条，订立书面合同7日内，中标人应当将合同送工程所在地的县级以上地方人民政府建设行政主管部门备案。