遇到诽谤起诉的程序如下：

1、向人民法院提起自诉；

2、递交自诉状或者口头告诉；

3、人民法院进行审查，决定是否立案，并书面通知自诉人；

4、决定立案的，自诉人应提交相应证据。

【法律依据】

《刑事诉讼法》第二百一十一条，人民法院对于自诉案件进行审查后，按照下列情形分别处理：

（一）犯罪事实清楚，有足够证据的案件，应当开庭审判；

（二）缺乏罪证的自诉案件，如果自诉人提不出补充证据，应当说服自诉人撤回自诉，或者裁定驳回。

自诉人经两次依法传唤，无正当理由拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，按撤诉处理。

法庭审理过程中，审判人员对证据有疑问，需要调查核实的，适用本法第一百九十六条的规定。