集体土地使用证登记法律规定的流程是：1、申请；农村村民个人向所属乡镇国土资源管理所提出申请。2、调查；由乡镇国土资源管理所对申请者的用地进行地籍调查、地籍测量。3、审核；由乡镇国土资源管理所进行审核，再报县国土资源局审核。4、审批。经审核过关，公布无争议的，由县人民政府颁发集体土地使用证。

【法律依据】

《土地管理法》第十一条，农民集体所有的土地，由县级人民政府登记造册，核发证书，确认所有权。 农民集体所有的土地依法用于非农业建设的，由县级人民政府登记造册，核发证书，确认建设用地使用权。 单位和个人依法使用的国有土地，由县级以上人民政府登记造册，核发证书，确认使用权；其中，中央国家机关使用的国有土地的具体登记发证机关，由国务院确定。 确认林地、草原的所有权或者使用权，确认水面、滩涂的养殖使用权，分别依照《中华人民共和国森林法》、《中华人民共和国草原法》和《中华人民共和国渔业法》的有关规定办理。