长期工干了两个月就走一般不会扣工资的。

如果仍然属于试用期内的，需要提前三日通知用人单位解除劳动合同，过了试用期的，需要提前三十日以书面形式通知用人单位解除劳动合同。

但如果签了长期合同，可能存在违约赔偿的问题。

用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。

违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用。用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。

用人单位与劳动者约定服务期的，不影响按照正常的工资调整机制提高劳动者在服务期期间的劳动报酬。

【法律依据】

《劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。