当农村土地被占用时，权利人可以通过以下方式维护自己的权利：

1、与直接侵权人协商，制止侵权行为；

2、向当地村委会和派出所寻求调解；

3、可以去农村土地纠纷仲裁机构仲裁。

4、收集侵权证据，然后上法庭，要求停止并终止占用。

依法占用、征用和承包土地的，有权依法取得相应的补偿和法律、行政法规规定的其他权利。

【法律依据】

《中华人民共和国土地管理法》第十四条，土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。

单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。

当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。

在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。