1、两个儿子在一个户口本上，也就是只有一户未分户时，应由该宅基地的原户主确权。

2、当事人的两个儿子未单独立户的，是不能以各自的名义办理该确权手续的。

3、两个儿子分别立户的，更多的时候都是将宅基地确权在一户名下，得到宅基地的对另一户进行补偿，这也是比较合理的确权方式，只不过这就需要两户家庭进行协商了，协商不成的，由人民政府处理。

【法律依据】《土地管理法》第十四条，土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。

单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。

当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。

在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。