股东表决权比例的确定方法是由股东按照出资比例行使表决权。根据《公司法》第四十三条规定，股东会会议由股东按照出资比例行使表决权;但是，公司章程另有规定的除外。这里的“出资比例”是占注册资本(认缴出资)百分比，还是占实收资本的百分比，《公司法》没有明确。

股东表决权又称股东议决权，是指股东基于股东地位享有的，就股东会、股东大会的议案做出一定意思表示的权利。股东表决权作为一种固有权、共益权，是股东权利的主要体现。