股份转让协议未付款有效。协议只要符合法律规定，不存在无效情形，自签订后就具有法律效力。

如果一方签订协议后不付款，这属于违约行为，而不是属于致使协议无效的行为，此时另一方可以要求违约方承担违约责任。

【法律依据】

《合同法》第52条，有下列情形之一的，合同无效：

(一)一方以欺诈、胁迫的手段订立合同，损害国家利益；

(二)恶意串通，损害国家、集体或者第三人利益；

(三)以合法形式掩盖非法目的；

(四)损害社会公共利益；

(五)违反法律、行政法规的强制性规定。