避免股东在退出公司时发生纠纷的方法有很多，其中一些常见的方法包括：

1、制定明确的股东协议：股东协议是股东之间的一份重要文件，它规定了股东的权利和义务，以及股东在退出公司时的程序和条件。制定明确的股东协议可以避免股东在退出公司时发生纠纷。

2、进行充分的沟通：在股东退出公司之前，公司应该与股东进行充分的沟通，了解股东的意图和需求，并尽可能满足股东的要求。这样可以避免股东在退出公司时发生纠纷。

3、进行公平的估值：在股东退出公司时，公司应该对股东的股权进行公平的估值，以确保股东得到合理的补偿。这样可以避免股东在退出公司时发生纠纷。

4、寻求专业的法律意见：在股东退出公司时，公司应该寻求专业的法律意见，以确保股东的权益得到保护。这样可以避免股东在退出公司时发生纠纷。

【法律依据】

《公司法》第四十六条　有限责任公司章程应当载明下列事项：

（一）公司名称和住所；

（二）公司经营范围；

（三）公司注册资本；

（四）股东的姓名或者名称；

（五）股东的出资额、出资方式和出资日期；

（六）公司的机构及其产生办法、职权、议事规则；

（七）公司法定代表人的产生、变更办法；

（八）股东会认为需要规定的其他事项。

股东应当在公司章程上签名或者盖章。