单位交的医保和农村医保的差别如下：
1、医保缴费的主体的不一样：
（1）职工基本医疗保险是指国家通过立法强制规定，用人单位和社会成员个人共同缴纳医疗保险费，建立医疗保险基金制度。
（2）农村医疗保险是由政府组织、引导、支持，秉持农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度。
2、医保缴费数额不一样：
（1）职工基本医疗保险是用人单位和职工共同缴纳的，用人单位缴费率应该控制在职工工资总额的6%左右，职工缴费率一般为本人工资收入的2%。
（2）农村医疗保险个人每年缴费标准不能采取个人缴费、集体扶持和政府资助相结合的方式筹集资金。是根据地区经济条件来划分缴费标准的，有每年100元、200元、300元、400元、500元，各个地方根据自身的情况来设置缴费的档次，多缴多得。
3、医保报销的比例不一样：
（1）职工基本医疗保险参保人拥有医保个人账户，定期会有费用划入，报销比例较高，有起付标准，限额较高，医疗费不封顶。职工基本医疗保险参保人员完成缴费年限后可以终身享受。
（2）农村医疗保险是没有个人帐户的，报销比例也比职工基本医疗保险要低，限额较低，并且是一年一参保，参保本年度享受的报销。