通常情况下，个体口腔诊所的负责人不能再担任另一家企业制度诊所的负责人。

依据相关规定，在个体申报设立的医疗机构中，法人和负责人通常为同一人，且此人需持有有效的医师执业证书，并具备至少五年的相关从业经验（或者拥有中医专长资格认证）。作为法定代表人，将代表诊所对外承担法律责任，而诊所的实际负责人则需对内部事务负责，承担相应的管理职责。虽然医师可以多点执业，但一般不能同时担任多个机构的负责人。

你所查询到她的医师执业资格上只有一个主要医疗机构，没有备案多地执业，且执业机构没有你所去的那个诊所，然而她还是那个口腔诊所的负责人，这种情况下，她不符合同时担任另一家诊所负责人的条件。如果她要担任另一家企业制度诊所的负责人，需要按照规定进行相关的变更手续，并满足相应的资质要求。具体规定可能因地区而异，建议咨询当地卫生健康行政部门或相关机构以获取准确信息。